Candida auris : Menaces croissantes et conséquences futures

Candida auris comme menace mondiale

Les CDC (Centers for Disease Control and Prevention [Centres de contrôle et de prévention des maladies]) des États-Unis ont qualifié Candida auris de « menace mondiale », jugeant urgent le niveau de menace.¹C. auris, un agent pathogène fongique, a émergé comme un problème de santé grave en raison de son potentiel de causer des infections invasives et d’augmenter la résistance aux médicaments antifongiques. First discovered in 2009 in Japan,² C. auris has rapidly gained attention as a potential cause of severe, life-threatening bloodstream infections and outbreaks in healthcare facilities such as hospitals and nursing homes.³  

Importance clinique de C. auris

C. auris colonise la peau et le nez de certains patients hospitalisés sans causer de maladie. La⁴ colonisation par C. auris peut se propager dans les établissements de soins de santé, car ce champignon se transmet vers des surfaces sur lesquelles il peut persister pendant des jours ou des semaines. La³ colonisation d’un patient peut persister pendant des mois, voire indéfiniment, ⁵offrant amplement l’occasion de se propager.

C. auris est un champignon particulièrement robuste et résiste à la décolonisation et aux agents désinfectants connus pour être efficaces contre d’autres espèces de Candida. ³Cela rend la gestion des épidémies particulièrement difficile.

Des maladies invasives graves ont été observées chez 5à 10 % des personnes colonisées. ⁶Ces infections s’accompagnent de taux de mortalité élevés chez les patients fragiles en milieu hospitalier et en centre de soins infirmiers, allant de 30 % à 72 %.³

Augmentation des cas pendant la pandémie de COVID-19

C. auris a été identifié en Asie du Sud, en Asie de l’Est, en Afrique, en Amérique du Sud et en Iran. Il s’est répandu à grande échelle sur tous les continents, sauf en Antarctique³, avec une augmentation des cas observés pendant la pandémie de COVID-19.⁷

C. auris a commencé à se propager aux États-Unis en 2015 et le nombre de cas signalés a augmenté de 318 % 2018 par rapport à la moyenne signalée de 2015-2017.¹Cela a amené les organismes de santé publique, les préventionnistes des infections, les chercheurs et les fournisseurs de systèmes diagnostiques à en prendre note.

L’un des aspects les plus préoccupants de C. auris est son niveau élevé de résistance aux médicaments antifongiques. Des échecs thérapeutiques ont été signalés avec certains médicaments antifongiques et une résistance généralisée à plusieurs classes de médicaments a été observée^{1,. 3}

Dans son rapport sur les menaces de résistance 2019 aux antibiotiques, le CDC a noté que ses experts en champignons n’avaient jamais reçu de rapport décrivant une infection à Candida résistante à tous les médicaments antifongiques, et encore moins à Candida qui se propage facilement entre les patients^1.

En réponse à la menace mondiale, le CDC a déclenché l’alarme aux États-Unis et a décrit C. auris comme l’une des menaces antimicrobiennes 5 urgentes pour la société.¹

L’approbation de la rezafungine par la Food and Drug Administration des États-Unis en 2023 offre une nouvelle option thérapeutique prometteuse pour les infections à C. auris, ⁸mais une détection rapide et précise des champignons est essentielle pour gérer cette menace.

Détection et identification en laboratoire

Le dépistage de C. auris chez les patients est une mesure préventive clé contre les éclosions dans les établissements de soins de santé. Cependant, la détection et l’identification précises de C. auris peuvent être difficiles.

Les systèmes d’identification phénotypique peuvent être inexacts, entraînant une mauvaise identification de C. auris.⁹ La culture des champignons nécessite des conditions de biosécurité spécifiques et prend des jours.

Le CDC recommande le recours à la spectrométrie de masse et à des méthodes moléculaires telles que le séquençage et la PCR pour détecter et identifier C. auris avec précision. Les isolats peuvent également être envoyés aux laboratoires de santé publique et de référence aux fins d’identification. Bien que ces mécanismes permettent d’obtenir des résultats précis, les établissements peuvent ne pas avoir accès à des technologies telles que la spectrométrie de masse et le séquençage. Le délai d’exécution pour l’envoi des échantillons aux fins d’analyse peut également entraîner des retards pendant la période critique pour détecter la colonisation et prévenir la propagation.

L’impact du dépistage par PCR à l’interne

La mise en œuvre de tests par PCR à l’interne pour dépister C. auris a donné des résultats positifs. Il permet d’identifier plus rapidement les patients colonisés et de réaliser des économies potentielles liées à l’isolement et aux tests. ¹¹Cette approche peut être plus efficace que l’envoi d’échantillons pour les analyser tout en fournissant des résultats fiables.

La route à venir

Alors que les cas de C. auris continuent d’augmenter et que la résistance aux antimicrobiens devient plus répandue, des solutions de dépistage plus rapides et plus précises seront des outils essentiels pour détecter les cas tôt et aider à prévenir les éclosions.

Il existe certains tests commerciaux basés sur la PCR qui détectent C. auris.⁹ Cependant, les tests actuels sont conçus pour être effectués par des professionnels formés dans des contextes de laboratoire.

De tels tests pourraient ne pas être facilement accessibles dans des milieux comme les maisons de soins infirmiers, où les patients les plus sensibles aux infections graves à C. auris peuvent résider.

Un prototype de test de surveillance rapide et sur demande pour C. auris a été conçu pour fournir des résultats précis en moins d’une heure dans des milieux proches du patient.¹⁰

Le prototype de test est conçu pour être exécuté sur le système GeneXpert® de Cepheid, qui permet de procéder à des tests en laboratoire et au plus proche des patients. Un tel test pourrait mener à une détection précoce et à une intervention dans les établissements de santé, ce qui pourrait améliorer les résultats cliniques, financiers et opérationnels.

C. auris présente un défi de taille pour les systèmes de santé du monde entier en raison de son potentiel de causer des infections invasives, des taux de mortalité élevés et une résistance aux médicaments antifongiques. La vigilance, l’éducation du personnel, l’évolution des lignes directrices, la mise au point continue de médicaments et de méthodes de désinfection ainsi que des solutions de dépistage novatrices sont essentiels pour faire face à cette menace émergente.