OncoMark

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2014

Die ursprüngliche Erfindung im Zusammenhang mit der OncoMasTR-Technologie wurde gemeinsam vom University College of Dublin und Trinity College Dublin mit den Erfindern Bracken, Lanigan und Gallagher eingereicht.

2015

Einschlägige, von Experten begutachtete Veröffentlichung: 

- Lanigan F et al. Die Beschreibung von Transkriptionsnetzwerken mit prognostischen Gensignaturen verfeinert die Behandlungsempfehlungen für lymphknotennegative Brustkrebspatient/innen. FEBS J 2015; 282:3455-73.

Wichtige Punkte aus der Entdeckungsstudie von Lanigan et al.:

• ARACNe: Bioinformatik-Methode zur Konstruktion von Genregulationsnetzwerken.
• „Welche Gene regulieren die prognostischen Gene in drei bestehenden prognostischen Signaturen für Brustkrebs?“ 
• Es wurde eine Gruppe von zehn „Master-Transkriptionsregulatoren“ (MTRs) identifiziert.
• Aus einer Untergruppe der MTRs, die sich als prognostisch für das Überleben von Brustkrebs erwiesen haben (mRNA- und Proteinebene), wurde ein Basis-Risikoscore erstellt.

2016

Entwicklung von OncoMasTR bei OncoMark

Wichtige Schlussfolgerungen aus der Produktentwicklung:

• Unter Verwendung einer klinischen Probenkohorte mit Langzeitergebnissen („konsekutive Kohorte“, n = 225, 37 Fernrezidivereignisse) wurde eine 3-Gen-Signatur entwickelt und optimiert, die die Gene FOXM1, PTTG1 und ZN367 (FPZ, im Folgenden) umfasst.    
• Aus dieser 3-Gen-Signatur wurden drei FPZ-basierte Risikoscores abgeleitet:

     i. Ein molekularer nur numerischer Risikoscore (0-100)

    ii. Ein molekularer und klinischer numerischer Risikoscore (0-10)

   iii. Ein molekularer und klinischer kategorischer Risikoscore (niedrig, wenn Risiko <5, hoch, wenn Risiko ≥5)

2017

Einschlägige, von Experten begutachtete Veröffentlichung: 

- Moran B et al. Master-Transkriptionsregulatoren bei Krebs: Entdeckung durch Reverse Engineering-Ansätze 

- Die Schulung und Verifizierung des OncoMasTR-Assays wurde abgeschlossen und die Daten wurden auf dem San Antonio Brustkrebssymposium als Poster präsentiert. 

- Parallel dazu wurden weitere Entwicklungs- und Validierungsstudien nach CLSI-Richtlinien durchgeführt (analytische Validierung von OncoMasTR nach CLSI-Richtlinien: Genauigkeit, Linearität, Sensitivität, RNA-Eingang, Interferenz, Kitstabilität.)

2018

Der OncoMasTR-Test wurde gemäß der CE-IVD-Richtlinie mit dem CE-Zeichen versehen.

Es wurden drei unabhängige externe klinische Validierungsstudien unter Verwendung vordefinierter Risikoscores für den OncoMasTR-Assay initiiert:

1. TransATAC (n=646)
2. TAILORx (n=404), irische Untergruppe einer breiteren TAILORx-Studie.
3. ABCSG-8 (n=1.087)

Zusammen umfassten diese Studien FFPE-Proben von mehr als 2000 Frauen mit ER-positivem, HER2-negativem Brustkrebs im Frühstadium (Lymphknoten negativ oder 1–3 Lymphknoten positiv)

Wichtige Schlussfolgerungen aus den klinischen Validierungsstudien:

• OncoMasTR war in allen drei Studien signifikant prognostisch für Fernrezidive (distant recurrence, DR).
• In zwei der Studien (TransATAC und der TAILORx (irischen) Untergruppe), in denen Daten für vergleichende Analysen verfügbar waren, lieferte OncoMasTR dem Oncotyp DX^TM ein Rezidivscore (Recurrence Score, RS) mit einem überlegenen prognostischen Wert.

Cepheid und OncoMark beginnen Gespräche zur Zusammenarbeit, um eine GeneXpert-Version des OncoMasTR-Assays zu entwickeln.

2019

OncoMark begann an drei Prüfzentren eine reale, dezentrale Auswertung des OncoMasTR-Assays:

1. St James’ Hospital, Irland
2. Beaumont Hospital, Irland
3. Utrecht Medical Centre, Niederlande
4. Universität Lund, Schweden

Wichtige Schlussfolgerungen aus den Beta-Site-Tests und der analytischen Validierung (analytische Validierung von OncoMasTR gemäß CLSI-Richtlinien):

• OncoMasTR zeigt eine robuste analytische Leistung und ist potenziell für den dezentralen Einsatz geeignet. 
• Die Gesamtgenauigkeit von OncoMasTR war hoch, mit einer Standardabweichung von 0,16 (<2 % des 10-Einheiten-Risiko-Scorebereichs)
• OncoMasTR-Scores waren über einen > 100-fachen RNA-Eingangsbereich konsistent
  • Über 4 Teststandorte hinweg lagen die kontinuierlichen Korrelationskoeffizienten des OncoMasTR-Risikoscores bei 0,94–0,96 und die Konkordanz des kategorischen Scores betrug 86–96 %.

Cepheid und OncoMark gehen eine formelle Zusammenarbeit ein, um eine GeneXpert-Version des OncoMasTR-Assays zu entwickeln. 

2020

Einschlägige, von Experten begutachtete Veröffentlichung: 

- Buus R et al. Validierung des OncoMasTR-Risikoscores bei Östrogenrezeptor-positiven/HER2-negativen Patient/innen:
Eine TransATAC-Studie. Klinische Krebsforschung 2020; 26:623-31.

- Mazo C et al. Multigene prognostische Signaturen und Vorhersage des pathologischen Ansprechens auf neoadjuvante Chemotherapie bei ER-positiven, HER2-negative Brustkrebspatient/innen. Cancers 2020; 12(5):1133.

Cepheid weist der GeneXpert-Version des OncoMasTR-Assays den Handelsnamen Xpert Insight Breast Cancer zu.

Cepheid weist die analytische Gleichwertigkeit des Xpert Insight Breast Cancer Assays mit dem OncoMasTR Assay nach.

Cepheid weist die Übereinstimmung der Risikoscore-Berichterstattung zwischen Xpert Insight Breast Cancer und OncoMasTR in charakterisierten Proben nach.

2021

Einschlägige, von Experten begutachtete Veröffentlichung:

- Lynch SM et al. Prognostischer Wert des 6-Gen-OncoMasTR Assays bei Hormonrezeptor-positivem, HER2-negativem Brustkrebs im Frühstadium: Vergleichende Analyse mit klinisch-pathologischen Standardfaktoren. Eu J Can. 2021; 152: 78-79.

- Filipits F et al. Der OncoMasTR-Assay prognostiziert Fernrezidive bei Östrogenrezeptor-positivem, HER2-negativem Brustkrebs im Frühstadium: Eine Validierungsstudie in der ABCSG-Studie 8. Klinische Krebsforschung 1. Nov. 2021;27(21):5931-5938. 

Cepheid übernimmt OncoMark und den OncoMasTR-Assay.

Cepheid weist die klinische Gleichwertigkeit von Xpert Insight Breast Cancer mit OncoMasTR in FFPE-Proben mit Langzeitresultaten nach.

Cepheid initiiert Real-World-Evidenz- und klinische Validierungsstudien für den Xpert Insight Breast Cancer-Prototyptest.

2022

Einschlägige, von Experten begutachtete Veröffentlichung:

- Loughman T et al. Analytische Validierung des OncoMasTR-Assays, einer neuartigen Multigensignatur zur Vorhersage 
eines Fernrezidivs bei Östrogenrezeptor-positivem, HER2-Negative Brustkrebs im Frühstadium. Klinische Chemie. 2022; 68:6. https://doi.org/10.1093/clinchem/hvac028